Округ назван в честь реки Красненькая, которая протекает через Юго-Западные районы Санкт-Петербурга. Это название известно с 1773 года в форме «Красная речка» — в то время на её левом берегу находился трактир «Красный кабачок»

​

Фактически Красненькая речка является продолжением сохранившейся части Лиговского канала. Лиговский канал был проложен в начале XVIII векадля снабжения Санкт-Петербурга чистой питьевой водой из Дудергофских озёр. За прошедшие три века канал утратил значение и был изменён. Нижняя (городская) часть Лиговского канала засыпана до Краснопутиловской улицы, и теперь воды канала сбрасываются по руслу реки Красненькой. Изменилась и верхняя часть канала. Ранее он снабжался водой из реки Дудергофки. В настоящее время вода из верхней части Лиговского канала полностью отводится Нагорным каналом обратно в Дудергофку. Существующая на сегодняшний день часть Лиговского канала имеет свой небольшой водосбор. В зимнюю и летнюю межени естественный расход системы Лиговский канал-река Красненькая (при площади водосбора около 45 км²) составляет единицы литров в секунду.

​

Первоначально, до строительства Санкт-Петербургского морского порта, река Красненькая впадала в Невскую губу севернее современного устья. Затем, после строительства дороги на южный мол Морского канала, был прорыт канал от Невской губы до Красненького кладбища. Естественное русло реки было засыпано, а воды Красненькой стали отводиться по этому каналу. Соответствующая ситуация сохраняется до настоящего времени.